بررسی تنوع ژنتیکی ماهی سنگ لیس Garra persica (Berg, 1914) در استان کهگیلویه و بویراحمد با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره

نوع مقاله: مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانشجوی کارشناسی ارشد اکولوژی آبزیان، دانشکده شیلات و محیط زیست، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان 1

2 دانشیار گروه شیلات، دانشکده شیلات و محیط زیست، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

3 استادیار گروه محیط زیست، دانشکده شیلات و محیط زیست، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

چکیده

پژوهش حاضر با هدف بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت‌های ماهی سنگ لیس در دو رودخانه بشار و کبگیان استان کهگیلویه و بویراحمد با استفاده از شش جایگاه ریزماهواره انجام گرفت. در این پژوهش از 56 قطعه ماهی سنگ لیس استفاده گردید. بر اساس نتایج حاصله، متوسط شاخص Fst، 024/0 به‌دست آمد که نشان از تمایز ژنتیکی پایین بین جمعیت‌های مورد بررسی می‌باشد. تعداد الل مشاهده شده در محدوده 25- 7 و هتروزیگوسیتی مشاهده شده و مورد انتظار به‌ترتیب در محدوده 000/1- 000/0 (میانگین 595/0) و 946/0- 767/0 (میانگین 855/0) به‌دست آمد که بیانگر این مطلب می‌باشد که جمعیت‌های مورد بررسی از غنای اللی و تنوع ژنتیکی درون جمعیتی قابل ملاحظه‌ای برخوردار می‌باشند، درحالی‌که آنالیز واریانس مولکولی تنوع ژنتیکی پایینی را بین جمعیت‌ها نشان می‌دهد.

کلیدواژه‌ها


 Callen, D. F.; Thompson, A. D.; Shen, Y.; Philips, H. A.; Richards, R. I.; Mulley, J. C.; Sutherland, G. R.; (1993). Incisence and origin of ‘null’ alleles in the (AC)n microsatellite markers. American Journal of Human Genetics; 52: 922-927.

Carvalho, G. R.; Hauser, L.; (1995). Molecular genetics and the stock concept in fisheries. G. R. Carvalho and T. J. Pitcher, (Eds.), Molecular Genetics in Fisheries. London, Chapman and Hall; 55-80.

Chakraborty, R.; Leimar, O.; (1987). Genetic variation within a subdivided population. N. Ryman and F. M. Utter (Eds), Population Genetics and Fishery management. Washington: University of Washington; 89-120.

Coad, B.W.; (2010). [Website] http://www.briancoad.com (accessed 3 March, 2010).

Dahle, G.; Jorstad, K. E.; Rusaas, H. E.; Ottera, H.; (2006). Genetic characteristics of brood stock collected from four Norwegian coastal cod (Gadus morpha) populations. Marine Science; 63: 209- 215.

Dewoody, J. A.; Avise, J. C.; (2000). Microsatellite variation in marine, freshwater and anadramous fishes compared with other animals. J. Fish Biol.; 56: 461-473.

Dixon, T. J.; Coman, G. J.; Arnold, S. J.; Sellars, M. J.; Lyons, R. E.; Dierens, D.; Preston, N. P.; Li, Y.; (2008). Shifts in genetic diversity during domestication of Black Tiger shrimp, Penaeus monodon, monitored using two multiplexed microsatellite systems. Aquaculture; 283: 1-6.

Diz, P.A.; Presa, P.; (2009). The genetic diversity pattern of Mytilus alloprovincialis in Galician Rías (NW Iberian estuaries). Aquaculture; 287: 278-285.

Dudgeon, D.; Arthington, A. H.; Gessner, M. O.; Kawabata, Z. -I.; Knowler, D.J.; Lévêque, C.; Naiman, R.J.; Prieur-Richard, A.-H.; Soto, D.; Stiassny, M.L.J.; Sullivan, C. A.; (2006). Freshwater biodiversity: importance, threats, status and conservation challenges. Biol. Rev.; 81: 163-182.

Esmaeili, H. R.; Ebrahimi, M.; Ansari, T. H.; Teimory, A.; Gholamhosseini, G.; (2009). Karyotype analysis of Persian stone lapper, Garra persica Berg, 1913 (Actinopterygii: Cyprinidae) from Iran. Curr. Sci.; 96: 959-962.

Fergusen, M.; (1995). The role of molecular genetic markers in the management of cultured fish. G. R. Carvalhoand, T. J. Pitcher (Eds.), Molecular Genetics in Fisheries. London: Chapman and Hall. 81-104.

Ghodsi, Z.; Shabani, A.; Shabanpour, B.; (2011). Genetic diversity of Liza aurata (Risso, 1810) in the coastal regions of Golstan province, using microsatellite marker. Taxonomy and Biosystematics; 6: 35-47.

Hillis, D.M.; Mortiz, C.; Mable, B.K.; (1996). Molecular systematic. Signature associated.

Kalinowski, S. T.; (2005). Do polymorphic loci require large sample sizes to estimate genetic distances. J. Hered.; 94: 33-36.

Li, J.; Wang, G.; Bai, Z.; (2009). Genetic variability in four wild and two farmed stocks of the Chinese freshwater pearl mussel (Hyriopsis cuminggii) estimated by microsatellite DNA. Aquaculture; 287: 286-291.

Li, D.; Kang, D.; Yin, Q.; Sun, Z.; Liang, L.; (2007). Microsatellite DNA marker analysis of genetic diversity in wild common carp (Cyprinus carpio L.) Populations. Genetics and Genomics; 34: 984- 993.

Lind, C. U.; Evans, B. S.; Knauer, J.; Taylor, J. J. U.; Jerry, D. R.; (2009). Decreased genetic diversity and a reduced effective population size in cultured silver-lipped pearl oysters (Pinctada maxima). Aquaculture; 286: 12-19.

Lucentini, L.; Palomba, A.; Lancioni, H.; Gigliarelli, L.; Natali, M.; Panara, F.; (2006). Microsatellite polymorphism in Italian populations of northern pike (Esox lucius). Fisheries Research; 80: 251-262.

Magoulas, A.; (2005). Mitochondrial DNA. In Stock Identification Methods Applications in Fishery Science; 311-330.

McQuown, E.; Krueger, C. C.; Kincaid, H. L.; Gall, G. A. E.; May, B.; (2003). Genetic comparison of Lake Sturgeon population: differentiation based on allelic frequencies at seven microsatellite Loci. Great Lakes Research; 29: 3-13.

Mohamadian, S.; Rezvani Gilkolaei, S.; Kazemian, M.; Kamali, A.; Taghavi, M.; Rouholahi, Sh.; Laloei, F.; Nayerani, M.; (2010). The study of genetic diversity and population structure of Vimba vimba persa (Pallas, 1814) populations in the Eastern and Western coastline of the Caspian sea (Havigh River and GorganRoud River) using microsatellite markers. Taxonomy and Biosystematics; 5: 29- 39.

Neigel, J. E.; (1997). A comparison of alternative strategies for estimating gene flow from genetic markers. Annual Review of Ecology and Systematics; 28: 105-128.

Peakall, R.; Smouse, P. E.; (2012). GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update. Bioinformatics In press.

Rezaei, M.; Shabani, A.; Shabanpour, B.; Kashiri, H.; (2010). Genetic comparison of Caspian Sea Rutilus frisii kutum (Kamenskii, 1901) in Gorganroud and Cheshmekile (Tonekabon) rivers using microsatellite markers. Taxonomy and Biosystematics; 1: 1-15.

Rodzen, J. A.; May, B.; (2002). Inheritance of microsatellite loci in the polyploidy white sturgeon (Acipenser transmontanus). Genome; 54: 1064-1076.

Sambrok, J.; Fritsch, E. F.; Maniatis, T.; (1989). Electrophoresis of RNA through gels containing formaldehyde: Molecular Cloning, 2nd edn. Cold Spring Harbor, NY: CSH Laboratory Press. 743-745.

Sayili, M.; Akca, H.; Duman, T.; Esengun, K.; (2007). Psoriasis treatment via doctor fishes as part of health tourism: A case study of Kangal Fish Spring, Turkey. Journal Tourism Management; (28): 625-629.

Skalla, A.; Hbyheim, B.; Glover, K.; Dahle, D.; (2004). Microsatteletie analysis in domesticated and wild Atlantic salmon. Aquaculture; 240: 131-143.

Thorpe, J. P.; Sol-cava, A. M.; (1994). The use of allozyme electrophoresis in vertebrate systematics. Zoologica Scripta; 23: 3-18.

Utter, F. M.; (1991). Biochemical genetics and fishery management: an historical perspective. Journal of Fish Biology; 39: 1-20.

Van Herwerden, L. V.; Mcllwain, J.; Al-Ouf, H.; Al-Amry, W.; Reyes, A.; (2006). Development and application of microsatellite markers for Scomberomorus commerson (Perciformes; Teleostei) to a population genetic study of Arabian Peninsula stocks. Fish. Res.; 79: 258-266.

Wright, B. S.; (1951). The genetical structure of populations. Annual Eugenics; 15: 323-354.

Wright, S.; (1969). Evolution and the Genetics of Population, Vol. 2: The theory of Gene frequencies. University of Chicago Press.

Yeh, F. C.; Yang, R. C.; Boyle, T.; (1999). POPGENE version 1.3.1. Microsoft Window-bases Freeware for population Genetic Analysis. Retrieved from http://www.uallberta.ca/fyeh. On: 11 September 2008.

Yue, G.H.; Li, Y.; Lim, L.C.; Orban, L.; (2004). Monitoring the genetic diversity of three Asian arowana (Scleropages formosus) captive stocks using AFLP and microsatellites. Aquaculture; 237: 89-102.

Zar, J. H.; (1999). Biostatistical analysis, 4th Ed, Prentice Hall, Upper Saddle River, New Jersey.

Zhao, N.; Shao, Z.; Ai, W.; Zhu, B.; Brosse, S.; Chang, J.; (2005). Microsatellite assessment of Chinese sturgeon (Acipenser sinensis Gray) genetic variability. Ichthyology; 21: 7-13.